Detail Penelitian

Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Gen Heat Shock Protein 70 Pada Itik Lokal Sumatera Barat


by Admin | 1 hari yang lalu | 179 Dilihat | Kategori : Kesehatan

Detail Penelitian
Peneliti Kusnadidi Subekti, S.Pt, MP
Judul Penelitian Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Gen Heat Shock Protein 70 Pada Itik Lokal Sumatera Barat
Tahun penelitian 2018
Jenis Penelitian Riset Murni
Lokasi Penelitian Sumatera Barat
Status Penelitian Sudah Selesai

Abstrak


Kondisi suhu lingkungan didaerah tropis yang berkisar 230 – 320C melebihi suhu nyaman itik yang berkisar antara 18,30-25,50C, ditambah lagi dengan perubahan pola pemeliharaan dari tradisional menjadi intensif dengan kondisi terkurung minim air menyebabkan itik mengalami kesulitan dalam proses thermoregulasi, sehingga itik mengalami stres/cekaman panas. Stres ini akan bermuara kepada produksi dan produktivitas itik yang tidak optimal. Salah satu upaya untuk mengatasi masalah ini adalah memperbaiki mutu genetik itik lokal dengan menyeleksi itik yang tahan panas dan tidak tahan panas dengan menggunakan marka molekuler gen kandidat yaitu gen Heat Shock Protein 70 (HSP 70) yang dikenal sebagai gen penyandi tahan panas. Identifikasi keragaman single nucleotide polymorphism (SNP) gen Heat Shock Protein 70 (HSP 70) merupakan suatu langkah awal untuk melakukan seleksi sifat tahan panas dari itik lokal dalam menghadapi stres akibat cekaman panas. Tujuan jangka panjang penelitian ini untuk menciptakan galur itik tahan panas dengan menggunakan metode kandidat MAS (marker assisted selection) sifat tahan panas itik lokal dengan mengeksplorasi gen HSP 70 melalui identifikasi SNP. Pada penelitian ini didapatkan hasil yaitu terdapat 3 SNP yang dapat dikenali dengan metoda PCR-RFLP menggunakan enzim restriksi. Enzim HhaI mengenali 2 SNP (lokasi G+1410A / g.1696 dan C+1476T / g. 1762) dan SacII 1 SNP (lokasi T+1416G / g.1702). Enzim restriksi HhaI dengan lokasi SNP, G+1410A / g.1696 didapatkan dua alel (A dan G) dengan 3 genotipe yaitu (AA,AG,GG), Lokasi SNP C+1476T / g. 1762 didapatkan dua alel (T dan C) dengan 3 Genotipe (TT, TC, CC). Enzim SacII didapatkan juga 2 alel (T dan C) dengan 3 genotipe ( TT, TC, CC). lokus gen HSP70/HhaI dan HSP70/SacII semuanya polimorfik.

Link Terkait